薄闇の中に、かすかに響く水滴の音が反響し続けていた。それは、地下にひっそりと存在する、誰も知らない実験施設の冷んやりとした空気を切り裂くかのようだった。この場所は古い軍需工場の地下に位置し、表向きは閉鎖された研究所として立ち入る者は誰もいない。しかし、その奥には人の目を忍んで行われる恐ろしい人体実験が隠されていた。
実験を指揮するのは、大学教授としての経歴を持つ科学者、津田だった。彼は科学の力を信じ、倫理よりも成果を重んじる男だった。彼の目的は、未知の領域を探ること、人間の身体を驚異的な方法で進化させることだった。だが、彼の研究は次第に狂気へと変貌していき、科学の力が人間の限界を超えた時、何が起こるのかを目の当たりにすることとなる。
津田の実験の素材は、行き場のない者たちだった。ホームレスや孤独な老人、あるいは社会から見放された青年たちを次々と連れ込み、彼らを無償で助けると偽り、密かに被験者として使用した。彼らの記憶は消され、無意識のうちにあらゆる薬剤を投与され、体細胞を未知の薬品で改変されていく。
ある日、最も重要な被験者である青年、アキラが施設の中で目を覚ました。彼は過去の記憶を失い、どれほどの時間が経ったのかもわからない。ただ、体の内側からじわじわと熱が沸き上がり、それが自分の細胞の変異によるものだと直感していた。アキラは過去の自分を知ることはなかったが、少しずつ自分の体が変わり始めているのを感じていた。
ある夜、アキラは自分の体に異変を感じる。それはただの幻覚ではなかった。彼の皮膚はまるでガラスのように透明になり、その下で血管がうねるのを目視できるほどになっていた。彼は自分の手が白く光るのを見た。それは人間の領域を超えた、未知の生命体の輝きだった。
恐怖に駆られたアキラは、何とか逃げ出そうと試みる。だが施設の外は厳重に監視され、監視カメラがじっとアキラを睨んでいた。施設を抜け出すには、一瞬の隙を突かなければならない。しかしそれを成し遂げるのは極めて困難だった。
津田はアキラの変異が順調に進んでいることに満足していた。彼にとってアキラは成功の証であり、人類の未来を切り開く存在だった。しかし、倫理観を完全に失い、依然として彼は自身の行動が及ぼす人間への深刻な影響について考慮しようとしなかった。
あるとき施設内の電源が自動で何の予兆もなく落ち、突如として薄暗い闇が訪れた。その瞬間をアキラは見逃さなかった。無意識のうちに彼の瞳は、闇を見通す新たな力を得ており、彼は闇夜の中を自在に動けるようになっていた。まるで獣のように四つん這いで、息を殺しながら彼は施設を抜け出した。
外界へと踏み出したアキラの目に映ったのは、彼の記憶の中にはなかった街の姿だった。以前とは異なり、色すらも失ったように見える世界で、彼は迷った。彼の身体はこの異質な世界の中で徐々に馴染むことを拒否していた。人間であった頃の記憶がなかったとしても、この急激な変化に体が追いつけていないのだ。
アキラの内側で異変が起こり始めた。一つの細胞から無数の細胞が再編され、彼の体はまるで新たな種に進化するかのごとく再構築されていく。それは激しい痛みを伴い、彼の意識はやがて非現実の世界へと誘われた。呻き声が周囲の空気を震わせ、街路の陰から彼の異形の姿を目撃した通行人たちは、恐怖に駆られて逃げ去る。
そうした中で、アキラは何か重要な真実に気付いた。それは、津田の実験はただの狂気の産物ではないということ。この体験には、ある種の意味が隠されているということだった。アキラは自分の変化を受け入れることに努め、また自分と似た境遇にある他の被験者たちを探す旅に出た。
やがて、アキラは地下施設に取り残されたある少女と出会う。彼女もまた津田の被験者であり、アキラと同様の運命を辿っていた。彼女の名前はユウカ。彼女の体もまた徐々に変異し始めており、お互いにその痛みと苦しみを分かち合うことができた。
二人は再び施設へ戻り、計り知れない力を手に、津田と対面した。彼らの存在は既に人間ではなく、進化した新たなる生命体となっていた。二人の決意は固く、津田の実験を止め、自分たちのような被害者を増やさないために戦うことを誓った。
最後に、津田は自らの手によって生み出された彼らに倒された。しかし、その悲劇的な結末は、彼らにとっても決して望まれたものではなかった。二人は自らの失われた人間性に涙しつつ、何も存在しない夜の闇へと消えていった。
科学が許されることのできる範囲を越えたとき、人間は創造主から罰を受ける。そのことを人々は忘れてはならないのだ。進化とは何か、倫理とは何かを問い続ける日々が、再び訪れないことを願って。
